Lo archivos .IPA son basicamente zips y se los puede instalar en un Iphone sin la necesidad de usar iTunes:
unzip file.ipa
En el contenido ya descomprimido tienen el directorio Payload y el archivo iTunesArtwork. Solo queda copiar la aplicacion al Iphone: (por ejemplo la aplicacion Test):
scp -r Payload/Test.app iphone_ip:/Applications/
Como el archivo .ipa es un mero .zip no guarda los permisos correctamente, para lo que se le puede poner 0755 para los ejecutables y 0644 para los archivos comunes, pero pueden lograr el mismo efecto poniendo todos los permisos posibles asi ninguna app se queja:
Conectarse por ssh al iPhone y poner lo siguiente:
chmod -R 0777 /Applications/Test.app
Todo lo que queda hacer es restartear el springboard con: killall SpringBoard
y listo!!! a disfrutar! ojo que para todo esto necesitan tener hecho el jailbreak






